葛云飞率部兵临城下之时，蒋方震率部攻占南京城北岸，叛军面临4面攻击态势。5日以后南京破城，葛云飞于冯国璋率部分别进入城内。雷镇春由水路捷足先登，迅速于长江码头登陆上岸进入城内。由于雷部军纪败坏，再加上雷镇春纵容，属下官兵率先在城北开始抢劫。叛军残部从城东逃跑，冯国璋命令部属追击，葛云飞命令文彪在城内搜索残敌。
城被攻破后，战斗很快进入尾声。葛云飞、单峰率领卫队正在行进，南京情报站长赶来汇报：“报告督军，雷镇春部下在城北开始大肆抢劫。”“这群败类不去肃清残敌，反而趁火打劫必须严惩，立即告诉文彪，对于抢劫的士兵就地击毙。”葛云飞率领卫队策马沿着大街向北奔去，来到一处繁华街口，见一群士兵正在抢劫一处商铺，商铺老板满脸是血躺在地上。
葛云飞面色铁青挥了一下手，顿时枪声大作，正在抢劫的士兵倒在血泊中。几个小时之内，雷镇春的属下被击毙了300多人，抢劫势头得到遏制。
南京市府内，总指挥冯国璋表情肃穆，这时雷镇春气急败坏进来道：“总指挥，葛云飞胆大妄为，居然枪杀了我部300多名官兵，请你给我做主。”“根据葛云飞禀报，是败军残兵实施抢劫，难到你想承认是你的士兵干的？”冯国璋明知故问冷笑道。
“是我对部下约束不严，可是也不至于让他来管束，他的眼里还有袁大总统吗？”“愚蠢，现在是多事之秋，如果你想把事情闹大，葛云飞就敢公开弹劾你。我们是平叛大军，不是土匪，你的部下居然像土匪一般公开实施抢劫，大总统的颜面何在？纵容部下违反军纪给人以口实，你长了几个脑袋。葛云飞干的没有错，你就认了吧！”
“总指挥，你让我如何向属下交代？”“交代？你先为自己想想吧，葛云飞这样做，是为了政府的形象。他说是败军蚕残兵所为，这是为何？善后我来处理，为了避嫌，你部马上离开南京，由水路撤回河南！放心好处我会给你的！”“妈的，这件事情我与葛云飞结下梁子了，决不罢休。”这时葛云飞大步流星走进来，“哈哈，雷师长也在这里，辛苦！”葛云飞满面红光，似乎什么事情也没有发生。
雷镇春怒目而视，一跺脚离开。“总指挥，雷镇春这是什么态度，我是为他擦屁股，反倒成了仇人。”“葛督军，雷镇春是一介武夫，不要与他一般见识，你做的没有错，防止了事态扩大。“
”报告，京城来电！“一名属下把电报递给冯国璋。冯国璋看了一眼道：”葛督军，大总统来电，对于我等攻占南京表示祝贺。大总统任命我担任两江督军，梳理江苏、浙江军务。大总统决定，徐州划归山东管辖，安徽军务依然归你梳理！“
冯国璋把电报递过来，葛云飞笑道：“总指挥，我就不看了，下官明白大总统的意思。一切行动听指挥，属下即刻率部撤离南京。”葛云飞神态自若告辞。望着葛云飞离去的背影，冯国璋叹了一口气道：“此人太可怕了！”“督军言之有理，此人别看年轻，道行深不可测。瞧他笑容可掬的样子，是真的高兴还是不满？”
“葛云飞一路征战所向披靡，而且秋毫无犯，彰显文明之师，表面看是为袁大总统脸上添彩，可实质上是为自己沽名钓誉，他是二者都做到了。此番出兵名利双收。大总统把两江督军的职务给了我，却把徐州送给了他，安徽的军务给了他，这小子让大总统无可奈何。不过葛云飞的确是军事干才，以一旅之兵横扫安徽，似乎如无人之境，不是一般人能做到的。”
“督军，雷震春率部在河南绞杀白朗半年，居然被白朗屡屡得手击溃。葛云飞一出手便一举歼之，相比之下高下立判。”“这说明他是谋定而后动，早就关注白朗，甚至派人打入白朗内部，准确掌握其行踪，可见其心思缜密。”“难怪大总统如此器重。即便雷震春是大总统的红人，此番也是哑巴吃黄来，有苦说不出来。”
”雷震春头脑简单，看不出眉眼高低，纵容部下胆大妄为，这是咎由自取。日后若是于葛云飞做对，怎么死的恐怕都不知道。“
其实，葛云飞以抢劫为名，公开与雷震春作对，真正目的并不是以正视听。明知雷震春是袁世凯的心腹，就是借此敲打袁世凯要整肃军纪，北洋军不能胡作非为。
冯国璋突然有所感悟，认为自己是否太软弱，想到此冷汗冒了出来。葛云飞当着自己的面，豪无顾忌的枪杀雷震春的属下，难到他了解自己的心思？虽然冯国璋属于袁世凯的嫡系，但对袁很多做法并不赞成。后来袁世凯称帝，他站出来公开反对，正是源于对袁的失望。
正当冯国璋猜疑之时，葛云飞率部乘船渡江。“督军，这次我们和雷震春结梁子了！“单峰于站在甲板上，望着宽阔的江面打破沉默。”“雷震春一介武夫不可惧，我是做给袁世凯和冯国璋看的，此举是一石三鸟。其一，彰显我部是正义之师、军纪严明。其二，通过雷震春向袁世凯表明，不能纵容部下胡来，有损国民政府的形象和大总统的形象，其三，向冯国璋传递某种信息。”
“督军的意思是试探冯国璋的心思？”“根据我观察，冯国璋对袁世凯的独裁有反感。我击毙雷震春违反军纪的士兵，他似乎赞同，因此今后如何与他交往心里大致有数了。”“督军，没有想到这件事情牵扯如此广泛，我的确没有想到。”“官场如同没有硝烟的战场，而且杀人不见血更残酷。今后我们不仅要和日本人作战，还要面对各种势力，稍有不慎便万劫不复。”
葛云飞到达江北于蒋方震合兵一处，随即命令章耀武率领第5旅前往合肥驻扎。改编胡万年部命名为第6旅，任命胡万年为第6旅旅长。不久，大队人马乘坐火车前往济南。途中，文彪所部在徐州下车，暂时担任徐州的防务。白勇的独立大队在徐州上车，直奔济南。新改编的第6旅和独立大队，要在济南完成军事训练。
镜头转向京城，叛乱迅速被平定，袁世凯踌躇满志心情大好。总统府内总长段祺瑞道：“葛云飞率部已经回到济南，他要求给新编第5旅、第6旅正式番号。”“可以给正式番号，目前国民政府财政困难，只能满足第5师4个旅的军饷，另外两个旅军饷自筹。”段祺瑞笑道：”钱对于葛云飞不是问题，他要的就是番号。“
“大人，此番平叛，葛云飞的部队军纪严明、战斗力强悍，为国民政府、为大人争光添彩。作为奖赏多给两个旅番号也是应该的，国民政府军队若是都像葛云飞的军队一样，大人何愁江山不稳。“袁世凯道：”此番葛云飞在南京枪杀雷震春违反军纪的士兵，其实是对我有所不满，段总长你如何想？“”大人，大军平叛是正义之师，代表着国民政府乃至大总统的形象。“
“如果纵容士兵烧杀抢劫，岂不是兵匪一家、大总统的颜面何在，国民政府的颜面何在。下官以为，葛云飞做的没有错，只不过有些过激了。“”葛云飞的衷心不容怀疑，可是他年轻了。“”大人，葛云飞此举势必引起各将领不满，但更有利于大人驾驭。他们之间有矛盾，对于大人来说百利无一害。“”知我者晳子，好了这件事情过去了，我们来商量江南的善后。“
葛云飞班师回到济南，省长宋时远率领各界代表，举行了隆重的欢迎会。酒宴结束后，宋时远和葛云飞喝茶私聊。“葛兄，我听说袁大人，任命倪嗣冲为安徽都督兼民政长，这件事情你怎么看？”近朱者赤近墨者黑，时下宋时远已经不知不觉站在葛云飞的立场上着想。“宋兄，实不相瞒，我要的就是这个结果，军人不干政，文官不掌军。”
“不错你是这样做的，军政分离相互制约，有利于安定，所以袁大人让你梳理安徽军务！”“不错，倪嗣冲不掌控军权，就不敢为所欲为。宋兄，自从你担任省长后，我干涉过你吗？”“你倒是清闲了，我可是拧紧发条哇！”“这不正是宋兄想要的吗？”“葛兄所言极是，老夫现在可是越活越年轻，可这一切离不开你的鼎力相助。”
“宋兄能为一方百姓造福，也是下官所盼，彼此彼此！”“此番出征葛兄可是名利双收哇，昨天陆军部传来文涵，鉴于我等于德国人的良好关系，要求我们向德国订购5000支步枪，装备京城禁卫师。”“汉阳不生产步枪了？”“汉阳兵器厂，现在还没有恢复生产，陆军部急需这批步枪，这件事情拜托你于德国人周旋。”
“小事一桩，半个月就搞定，不过我想知道，陆军部的采购价格?””我知道你想从中捞油水，价钱肯定会让满意！“葛云飞闻听窃喜，自己秘密兵工厂刚开张，便意外获得订单。时下秘密兵工厂开足马力一天能生产200支步枪，一个月交货没有问题。有了第一笔订单就会有第二笔。军火生意能持续一年时间，可以赚的盆满钵满。