瞳子她们这次的目标是紫水晶——“奥尔菲”。尽管她们告诉藏有这枚水晶的岛津美术馆，猫眼将来行窃，可美术馆却丝毫没有通知警察的迹象，这一点，她们略感有些不安，但还是潜伏到美术馆里。此时，科长准备待猫眼来送“行窃战书”时将她抓获，便命令俊夫和浅谷悄悄地埋伏在美术馆里，他俩偶然发现猫眼，并紧跟其后，在那里，俊夫他们却遇到了巡视的老虎。瞳子为了帮助俊夫，跳到了老虎面前……
俊夫兴致勃勃地来到瞳子的住处，但此时瞳子还心想着下一个目标——“春天的少女”。看到瞳子这个态度，俊夫想可能是求婚尚早，待自己奋力将猫眼抓获之时，也许便会成功了。下定决心的俊夫制定了详细的行动计划来阻止猫眼盗窃“春天的少女”。他信心百倍地在美术馆里守卫着。与此同时，瞳子她们没有注意到俊夫的作战计划，仍像往常一样，开始着手制定窃取“春天的少女“的行动方案。
俊夫一心想早日捉到猫眼。他通过查阅以前有关猫眼的案宗后，发现了一定的规律，便推断出猫眼此次的目标不是金银首饰，而是以名画为主的艺术品。俊夫为了弄清这其中的关系，四处查访，终于查明猫眼的目标就是德国画家——海恩茨的收藏品。瞳子她们探听到有关俊夫的动向后，仍然把名画作为她们的下一个目标，俊夫的推理是对还是错呢？
俊夫确信，海恩茨的过去和猫眼的真实面目这两点之间有着必然的联系。他以德意志联邦国外秘密调查部提供的情报为线索，从与海恩茨过去有关的一幅名为“风”的画入手进行调查。俊夫向原驻德国大使——入江先生那里借来这幅画，采用红外线扫描发现，在画的下面，画有日本海岸的风景，这说明，此画是在一特定的场所描绘的。但是，就在俊夫不断逼近问题的核心时，却收到了来自猫眼准备下一次行动的意外通知。
销声匿迹的醍醐二郎时隔20年后回到日本，他是海恩茨作品的收藏家。他用海恩茨的画“人鱼”贿赂“玛美多”号的船长，才得以回国。瞳子她们了解到此船上有“人鱼”画，便上了“玛美多”号。醍醐知道她们是海恩茨的女儿，便在船上等待她们。醍醐对她们说：“如果信任我的话，我就带你们去欧洲”。瞳子她们为了能得到爸爸——海恩茨的消息，就决定接受醍醐的邀请，去欧洲看一看。
为了能够寻找到父亲，瞳子、泪子和小爱三人在巴黎继续扮成名画大盗。可不久便有“东京出现假猫眼”的消息传来，于是三人匆匆放弃了欧洲这边任务，迅速回国了。俊夫在与金发的假猫眼搏斗中受伤住院了。瞳子去医院探视。此时，病房的窗户被打破，猫眼的卡片投了进来，上面写着，“今晚银座国际大厦中展览的宝石——天鹅之泪将被偷”。瞳子对于这个明显是想欺骗自己的通告，决定孤身前往。在现场，出现的却是假猫眼——卡特莉奴，她竟然劝说瞳子与她合伙一道干。
瞳子她们探明父亲的画——“黄金之道”被歹徒团伙中的前岛得去。泪子为夺回此画，与前岛接触。但是，俊夫却突然出现了。俊夫因为总是抓不到猫眼，从刑侦处被调离，来到了专门对付歹徒团伙的刑侦四处。俊夫在焦急地等待前岛进行毒品交易，准备在现场出其不意将他擒获带回警署。正当此时，前岛却在开始准备绘画展了。俊夫又收到猫眼的预告，于是，他就准备将两人一起抓获。
猫眼偷完两幅名画“水边”和“夜翼”返回时，遇到了火灾，为了救孩子，她只好放弃了画。第二天的报纸登载了“是英雄还是窃贼”的醒目标题，引起了轰动。美术收藏家——密史塔利用猫眼同情孩子这一点，绑架了20个幼儿向猫眼勒索赎金，又故意把猫眼丢失的两幅画偷来。瞳子她们没有办法，只好依他，如果夺回画，孩子就回不来了。不了解事实真相的人们都怀疑是猫眼拐骗了孩子……
这次猫眼的目标是儿玉美术馆中的画“塞来茵”。那里一扇窗也没有，而且被半米厚的墙壁包围着。后面又是100米深的悬崖峭壁，在唯一的一个出口处，犬鸣警署还设置了一个定时锁。行窃预告虽然是今晚11点，但细心的浅谷把定时锁一直定到了第二天晚上11点，俊夫也进入了24小时的警备状态。为避开警戒线，猫眼从排水管中潜伏了进来。迷迷糊糊的俊夫开始做起梦来，他梦 见自己抓到了猫眼，却吓了一跳，原来竟是瞳子。
香港的一批名画将被运来展览。本部特别行动处的水室科长，为了能够抓住猫眼，开进了犬鸣警署，制定了名叫“热狗”的作战方案。特别行动处命令犬鸣警署的人扮成强盗团伙去抢劫这批香港名画，他们推测，猫眼由于怕强盗团伙抢走名画，便会提前下手，然后趁机将猫眼抓住。但是，唯一知道这个方案的科长却生病住院了；而全然不知的俊夫，只好一个人去对抗这假强盗团伙了。瞳子已逐渐了解这个圈套，在向名画逼近时，但却突然被关进了大型保险库里，处于危险之中。
一个月内就发生了23起神出鬼没的偷盗事件，这些都是107号罪犯所为。虽然警方开始大范围地进行设防，俊夫的奖金还是被偷走，辛辛苦苦攒了4个月的房租没了，俊夫只好到来生瞳子家借宿。可107号竟然偷到了来生家。录音机和俊夫送给瞳子的磁带都被偷走了。录音机里有刚刚到手的石印“萤火虫之女”啊！三姐妹为了在石印被偷偷拍卖之前夺回它，开始行动了！
和泪子、瞳子、小爱一起生活的俊夫天天吃着可口的饭菜，过着非常满意的生活。但是，由于作为警察的俊夫在这里，她们就无法商议下一步的行动计划。此时，沙鲁特尼亚共和国发生政变，他们送的“丝绸之路”瞳子父亲唯一的壁画，被立刻送回了国。焦急的三姐妹将俊夫撵了出去，开始制定作战计划。俊夫出去吃饭，吃的不好，很不适应，便回到家里。
本部在欧洲的慈善团体Abc财团拥有的名画“乳白的路”被猫眼偷走。俊夫叹息错过了此次机会没能将猫眼抓获。财团社长克那利，对于这属于世界文化财产的名画在日本被偷一事极为恼火，要求日本政府在他回国时乘船带回去。事实上，这个克那利是假的，猫眼偷的画也是假的，他这么做只是想更安全地把画运出国。
小爱把从小针商社社长那里偷来的价值5亿日元的宝石藏在了某个巡逻车里，她想不起来是哪一辆车了。当她想起是俊夫的车子时，俊夫已和瞳子一起去了海边，正在调查歹徒团伙中的阿明偷巡逻车一事。阿明的车和瞳子的车在激烈地追逐着，此时一直在追踪小爱和泪子的一针一伙也插了进来，一场大混战开始了。
专门偷盗美术品的28号窃贼，在偷“青铜骑士”时被抓住，可却到处找不到物主。如果是误抓，俊夫将受到处罚。在拘留所里，28号罪犯和加比厄之间进行着密谈。探听到这一情况的猫眼将28号从拘留所中偷偷地放了出来。与此同时，她让永石假扮成加比厄与28号罪犯接触，眼看就要成功时，却让28号罪犯跑了。
40年前，父亲在德国期间，曾教过他画画的一位老师出现在瞳子的茶馆里。他告知：在奥兰多酒店，即将举行葡萄酒拍卖会上，葡萄酒瓶上的标记是她父亲的画的。这批葡萄酒，是当时作为珍品送给日本的。在运送途中，船被击沉。事隔39年，才被打捞上来，现在仅剩下一瓶完好无损。猫眼巧妙地从俊夫看守的会场将这瓶葡萄酒取走，却发现在酒瓶上的标记后面有奇怪的化学方程式。
猫眼偷得的“桃青”和“彷徨”这两幅画相继被主人高价买了回去。俊夫开始怀疑：猫眼仅仅是为了钱才当强盗的吗？但是，从现在的瞳子、泪子和小爱身上却看不到这一点。而此时，俊夫却发现：午夜两点钟小爱还夹着一个包在外面。瞳子和泪子也怀疑，应该在家里的小爱怎么会采取这种行为。而小爱自己却好像没意识到似的。她们一经调查才发现：小爱被她的好朋友矢吹信一送来的电影录像给迷惑了。
泪子和小爱准备从横浜的村川官邸偷“水边的浴女”一画。这幅画是村川的女儿绿子偷来的。绿子坚信，虽然这幅画给父亲添了麻烦，但父亲对这幅画是要比对自己还要小心。村川担心女儿的安全，便雇佣了私人侦探迟田。小爱假装自己是离家出走的女孩，与绿子成了好朋友，在绿子的公寓里，小爱看见了“水边的浴女”这幅画。而在她身后却是偷偷靠近的迟田的影子。尽管迟田的办案本事很大，但他还是对金钱贪得无厌。危险在一步步靠近小爱。
猫眼下一个目标是父亲曾收藏过的宝石，可它却被歹徒团伙事先夺走了。被盗走的宝石由于被脚蹭了一下，不值钱了。布洛准备用刀将其修复。于是，瞳子假扮成现已死去的着名刀工师傅村田弦藏的女儿与强盗团伙中的勃斯和高见迟接近。俊夫想把名为“星星的眼泪”名贵锉刀送给瞳子，搜查也随即开始了。
这一次的目标是滑雪场附近教堂里的“圣母玛利亚”画像。俊夫制订的保护行动方案竟是假结婚仪式。新郎是俊夫，新娘当然是瞳子了。可没想到的是，瞳子断然拒绝，俊夫只好让浅谷来扮假新郎，瞳子这才答应穿上了婚纱。泪子和小爱也出席了。看来似乎要放弃“圣母玛丽娅”画像了，但不愧是猫眼，最终还是在大厅广众之下将其盗走。但偷来的画却是假的。到底是谁调包了呢？
“雪野之女”这幅名画保存在长谷部画廊中坚固的保险箱里。知道这个秘密的人只有社长长谷部一人，而且钥匙也在他手中。瞳子和小爱假扮成客人进入画廊探听虚实。长谷部看到瞳子的眼神有些异样，于是便打电话给犬鸣警署的科长。刑侦一处的俊夫正在对三个美女进行拐骗的案件实施调查，并要求给予支援。听到此事后，他想，瞳子去那里做什么呢？俊夫亲眼看到瞳子和一中年男子在一起，便开始着手调查瞳子是否与拐骗案件有关。
横须贺港停靠着美国第七舰队的驱逐舰“卡勃迪”号。水兵马克在甲板上和卡西谈情说爱。坐在气球上的瞳子临时着陆。甲板上催泪弹的爆炸使马克倒下了。正在瞳子呆愣的时候，经泪子帮助偷到的宝石却一下子不见了。一帮匪徒从“卡勃迪”号上抢走了大量武器弹药。结果马克一人背了黑锅，大家都认为只有他知道宝石的下落。猫眼救出了马克，但却暴露了自己的真实面目。
怪盗“冬天的萤火虫”连日来大肆行窃珠宝店。犬鸣警署却由于人手不够无法将其辑拿归案，科长急得团团转。此时，一个电话打来，顿时令科长愁眉舒展，原来是科长的老相好打来的电话。小爱、瞳子、泪.
无印 ：宝可梦 在无印篇中，新手训练家小智从大木博士那里获得的是一只勉强又喜怒无常又不喜欢进入精灵球的皮卡丘，小智离开了家乡真新镇，在关都地区展开他的旅程。在赢得皮卡丘的信任后，小智认真地开展他的旅程来挑战各地的道馆，参加宝可梦联盟。
在旅途中加入小智的是两位良师益友——小刚和小霞。 参加石英大会后，小智受大木博士委托启程前往橘子群岛，从内木博士那里取得GS球，小刚暂时留在内木博士那里。旅途中小智参赛橘子联盟，还遇到宝可梦观察家小建，便与他一同旅行。回到真新镇后，大木博士无法理解怎么样把GS球打开，所以就把小建留下做助手，派小智、小霞、小刚前往城都地区，把GS球交给桧皮镇的钢铁先生。
后参加了宝可梦联盟－城都联盟的白银大会。
宝可梦 超世代 城都联盟篇结束后，小霞为了接替出门旅行的三位姐姐而不得不返回华蓝市担任道馆馆主，小刚也因为因家里有事和小智分开了。小智重新出发，因为想要以一个新人的心态继续学习的心态，所以只带着皮卡丘只身前往丰缘地区，在那里认识了新人训练家小遥和她弟弟小胜，后来小刚又重新加入，于是四人并展开全新的冒险。超世代共分为丰缘联盟及对战开拓区两篇，和第一部的不同的是，故事变成了两条主线：一方面小智为了参加丰缘联盟，努力挑战道馆而收集徽章。
联盟大会结束后，改为挑战故乡关都地区的对战开拓区；另一方面小遥以成为顶级协调训练家为目标，挑战各地的宝可梦华丽大赛取得缎带，参加华丽大型庆典。两人都为了达成各自的目标，与宝可梦一起奋斗。
宝可梦 钻石&珍珠 对战开拓区篇结束后，小遥为了独自挑战城都地区的华丽大赛和小智告别，小胜回到了橙华道馆。小智受到了小茂的鼓励，独自带着皮卡丘和偷跟去的的长尾怪手前往神奥地区开始新的挑战。 小智、小光和小刚3人的旅程并非一帆风顺，他们在路途上遇上很多人和事，小智曾惨败给真司，小光也曾在2次宝可梦华丽大赛的第一次审查惨遭淘汰出局。
几经辛苦，小光终于集齐5枚缎带徽章，她在神奥华丽大型庆典表示出色，第一次参加便晋级决赛，但在决赛以稍微差距输给好友小望；小智也集齐8枚徽章，他在神奥联盟有好得开始，在第1回战打败尚志，第2回战打败某女路人，第3回战(16强)打败考平，8强更打败真司，可是他无法势如破竹而在准决赛惨败给达克多，在4强出局。 神奥旅程随着神奥联盟结束而来到尾声，小智及小刚曾邀请小光一起前往关都地区，但小光因卷卷耳被邀请而不能前来，当天的日落，小智在码头上和小光以最后一次击掌道别，与皮卡丘及小刚乘船返回关都地区。第二天日出后，小智和小刚回到关都地区，在前往真新镇及深灰市的分叉路口，小智和小刚握手及互相祝福对方后正式告别。小智和皮卡丘终于看见真新镇，他们跑进返回真新镇前的最后一段路，神奥之旅程正式划上句号。
宝可梦 超级愿望 讲述小智和皮卡丘踏入新的冒险舞台——合众地区，这里居住着许多他们所不知道的宝可梦。当小智知道合众地区的宝可梦后，便马上报名和踏上新的旅程，途中更遇上艾莉丝、牙牙与天桐，新的冒险就这样开始了。而跟着冒险而来的是脱胎换骨的火箭队，另外在寻找新的宝可梦以及新的邂逅的道路上，有更多的考验在等着他们。 随着小智取得8个徽章,日本在2012年6月21日开始播放第二季，讲述小智一行人在合众联盟开始前，前往东合众地区参加宝可梦世界锦标赛青少年杯为开端的故事。
后来小智在合众联盟8强出局，随后在2013年1月17日开始播出第2季的新章节“Episode N”，重新诠释因3·11日本地震而未能如期播出有关的等离子队剧情。
“Episode N”结束后，在2013年4月25日播出第2季的另一新章节“杰可罗拉冒险”，故事中小智一行人离开合众地区，返回关都地区，期间经过杰可罗拉群岛，并在群岛展开冒险旅程。
宝可梦 xY 立志成为宝可梦大师的小智带着皮卡丘来到了卡洛斯地区，心中怀着新的理想告别了合众地区的同伴天桐和艾莉丝，在卡洛斯地区与新认识的旅行伙莎莉娜、希特隆、柚莉嘉三人和新的宝可梦相遇的冒险故事
小智使用（黏美龙、音波龙、甲贺忍蛙、摔角鹰人、烈箭鹰、皮卡丘）在最后一战羁绊甲贺忍蛙VS超级喷火龙中败北，获得亚军。在比赛之后，闪焰队对基格尔德实验并暴走结束。 卡洛斯地区的伙伴太阳&月亮 主词条：宝可梦 太阳&月亮 小智和皮卡丘前往阿罗拉地区，获得了能够增强宝可梦能力的Z手环，剧情不在是曾经的打道馆挑战宝可梦联盟，而是一起与同学莉莉艾、卡奇、水莲、玛奥、马玛内体验校园生活，目标是毕业，本作的风格与前作有较大的变化，着重展现宝可梦生机勃勃的生态，情节较偏向主角们的日常生活。最后的阿罗拉联盟对战，小智的鬃岩狼人（黄昏的样子）击败格拉吉欧的鬃岩狼人（黑夜的样子），获得阿罗拉联盟冠军。
阿罗拉地区的校园生活宝可梦旅途 宝可梦，是这个星球上不可思议的生物。 天空中、海洋里、森林里、街道上，世界上的每个地方都能看到它们的身影。 这是一个讲述了在宝可梦战斗中以最强为目标的少年“小智”，和梦想着得到所有宝可梦的少年“小豪”的故事。 与小智的伙伴“皮卡丘”，小豪的伙伴“闪焰王牌”为首，与许许多多的宝可梦们一起，现到无限广阔的宝可梦世界的冒险开始了。 那么…… 梦与冒险，朝着宝可梦的世界，Let's go。
旅途的冒险 宝可梦地平线 宝可梦，是这个星球上不可思议的生物。 天空、海洋、森林、城镇，各处都能看到它们的身影。 拥有不可思议的吊坠的帕底亚出身的少女，莉可。 拿着谜之精灵球的的关都出身的少年，罗伊。 以广大的宝可梦世界为舞台，莉可与罗伊的新冒险即将开始！ 等待着二人的邂逅，以及命运是——！？ 这是，通过冒险来“发现”重要的某物的故事 。
主角，故乡是关都地区真新镇，花子之子。是个朝气蓬勃、热爱宝可梦的少年。在旅途中，通过伙伴宝可梦的帮助，小智逐渐成长，不断磨练自己，挑战道馆，战胜困难前往下一个城镇，最终获得石英大会的参赛权，虽然取得了16强的好成绩，但小智并未就此满足。他继续前往新的地区旅行，与新的宝可梦邂逅，与新的伙伴们并肩作战、共同朝自己的目标前进，接受新的挑战，在阿罗拉联盟玛纳罗大会夺冠并击败库库伊博士。 拥有75只宝可梦，曾经拥有过85种宝可梦。