试探性的前哨战打了几天，汪大捷兵少不支，退回三水城死守。
两天后，保昌侯曹志建率军两万来到了三水。
汪大捷急忙迎接。
一见汪大捷，曹志建询问战况，汪大捷道明军百战之兵，训练有素，不可轻敌。
不料曹志建哈哈大笑：“无妨！明日吾请燃灯佛，护佑众儿郎刀枪不入。尔等只管大胆杀敌，严天凤必败！”
第二天作战，曹志建祭起法坛施法。
曹志建在军中宣传自己是燃灯佛转世，有法力护佑。
别说，这一招还真灵！信徒无数。
一见曹志建祭坛施法，曹军立即士气大振，就跟打了鸡血似的。一个个皆以为自己练成了刀枪不入的金钟罩、铁布衫。
三水战役打响。
明军排着较为稀疏的方阵，发起了冲锋。
明末时，火器已经开始普及，以往过于紧密的阵法已经不符合实战需要，方阵开始成为主要阵法。
曹军从佛朗机人处买来的火炮开始轰击，不时有士兵中炮倒地。
明军的佛朗机炮、虎蹲炮，不甘示弱，开炮还击。
有经验的老兵都知道，此时不能退，冲过火炮射程就可以活命。
接着弓箭手开始抛射，戴着八瓣黄铜盔，穿着厚实棉甲的明军将士，头顶藤牌，开始冲锋。
“呯！呯！呯！”
双方的火绳枪手，点燃了火绳。
严天凤部没有换装自生火铳，这种新型火铳产量不足，朱亨嘉目前只来得及给自己的两万多侍卫亲军更换。
不过即使全换成自生火铳，对战力影响也不大。十七世纪中期的燧发枪和火绳枪的威力、射程差不多，只是节省了点燃火绳的时间，每枪快个两秒而已。自生火铳的最大优势是在阴雨天作战。
很快地，双方展开了白刃战。
两方军士都是明军出身，战法战术几乎一模一样。区别就在于明军武器更为精良，而且前段时间东征西讨，有实战经验的老兵多。不过曹军也有自己的优势，那就是他们有精神信仰，认为自己有曹侯爷请来的燃灯佛护佑，可以刀枪不入。
渐渐地，曹军将士发现，刀砍在自己身上，也会死。这是怎么回事？难道自己心不够诚，神灵不保佑了？
一个又一个将士倒下去，曹军崩溃了。
曹志建见势不妙，收拢败兵，撤回三水城防守。
虽然吃了败仗，但三水城坚，严天凤一时也奈何不了曹志建。
两军正在对峙，忽报明军杨怀部攻下了顺德，斩杀了曹军大将、总兵欧正福。
杨怀和严天凤商议，分兵攻顺德后，即带着一万大军出发。
曹军主力尽在三水，顺德只有总兵欧正福部六千人驻守。欧部本部老兵只有两千，其余皆是新招募的新兵。
杨怀部忽然杀至，欧正福猝不及防，被明军抢上城头，砍了脑袋。
曹志建听闻丢了顺德，大惊。生恐明军由顺德攻打自己的老巢南海、番禺。
急忙从三水撤往南海，严天凤从后追杀，曹军死伤无数。
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严天凤和杨怀二人合兵后，包围了南海、番禺二城。
广州府乃广东第一大府，辖十五县一州，它的府治也与别府不同。
别的府基本上都是一府一治，而广州府却有两座府治，分为南海、番禺（后世的番禺和明时的番禺地理位置不同，后世的番禺向南迁移了）二县。
广州，一省重地。南海、番禺二城不仅修得城高池深，而且离得极近，互为犄角。
打南海，则番禺增援；打番禺，则南海增援。
严天凤和杨怀二将，沿着南海、番禺巡查了一番。连连惊叹：“不好打呀不好打！”
不好打，也得打。
广州攻城战开始。
严天凤、杨怀用了各种方法攻城，均告失败。
用撞车，敌方用“轰天雷”炸；用云梯，敌方用火油烧；用鹅车，敌方用礌石滚木砸；挖地道，对方反挖，以烟熏之??
最后，严天凤决定采用一种新式攻城法：“地穴爆破法”。
这是随营的工匠想出来的方法。明军挖出之字形地道至南海城墙底部，然后用密封的棺材，装满火药，封住空间，点燃火绳。
“轰隆”一声，硝烟弥漫。南海城抖了一下，然后岿然不动。
“地穴爆破法”并不稀奇，李自成攻打开封时就用过。当时，闯军挖地道至开封城下，点燃火药，轰的一声，开封城也仅仅抖了一抖而已。最后没办法，水淹了开封。
主要原因是当时的火药质量不行。“地穴爆破法”真正大规模用于攻城战，始于太平天囯起义。两百多年后的火药质量和现在的火药质量自然不是一回事。
当然，这个年代，“地穴爆破法”也有成功的。满清在辽东攻城时用过此法，成功破城。但那是一座小城，且年久失修，而且爆破前已被火炮轰击多时，城基松动。
曹志建见明军用爆破法攻城，吓了一跳。急忙下令，在南海城内离城墙两丈处，栽上木栅，以防明军炸墙破城。
严天凤见其他方法无效，一咬牙，下令蚁附攻城。
仗打得激烈，明军眼看就要攻破番禺城，曹志建弟弟曹四，从南海城拼死杀出，救了番禺。
严天凤见两城一时难下，下令围城。又分兵攻取各县。
曹军主力尽在二城，其余各县守军很少。
明军很快攻克了新宁、香山、新会、清远、从化、增城各县；东莞、龙门、宝安、连州（领本辖及阳山、连山两县）投降。
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“大哥，明军已攻克广州各县，吾军现在只余南海、番禺二城。如何是好？”曹四十分担心。
曹志建安慰弟弟：“小弟别急，再坚持几天。清国的大军马上就要伐明了，到时候吾等就可以脱险了”。
曹四急了：“大哥！难道您想投降鞑子？您忘了咱家跟鞑子的血海深仇了吗？”
曹志建和曹四本来都是沧州军户，清军攻破沧州时，家人殁于王事者九十三人。他们和鞑子有深仇大恨。
曹志建长叹一声：“孔有徳、尚可喜、耿仲明，他们哪个和鞑子没仇?最后不都降了鞑子吗？形势逼人啊！”
曹四火了：“要去汝去，吾宁可战死也不降鞑子”。
曹志建急忙安慰：“小弟勿急。等清军来了，吾二人趁明、清大战的时候，逃往镇峡关。那一带地形险峻，背靠瑶僮。到时候吾兄弟二人占山为王，自由自在！”
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严天凤、杨怀正拿南海、番禺二城没办法时，忽报水师已经攻下了蕉门、虎门炮台，沿粤江直抵广州。
严天凤大喜。他知道孙贵的船队可有一种宝贝：三千斤重的红夷大炮。
朱亨嘉给孙贵的水师添了六艘千料新型夹板大福船，每艘除三十门佛朗机炮处，还有三千斤红夷大炮六门。总共三十六门巨炮。
这种巨炮，用于攻城、海战是把好手，但是体型巨大、运输不便。要是从陆路运输，至少好几个月。从水道过来，却便捷得很。
严天凤急忙令孙贵把巨炮从战舰上卸下来，准备了大量驮马，终于将巨炮运至番禺城下。
严天凤令集中炮轰番禺，两日后轰塌城墙一角，城破，曹军大将汪大捷阵亡。
最后的血战在南海城爆发。
炮声隆隆，三日后南海城破，曹志建、曹四均战死。
严天凤拿下广州不久，即传来消息：清军金声恒部攻下了赣州；清军李成栋部攻下潮州、惠州，逼近广州；南雄府降清。
严天凤急令杨怀部进驻韶州府英德县，沿连州、阳山、英德之间的湟水（即现在的广东连江）布防；自己亲领大军在广州佛冈、龙门七星冈、罗浮山一线依险布防；东莞、新安、南海卫一带，交由林察、孙贵的水师布防。
严阵以待，静候李成栋。
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朱亨嘉得知严天凤已经攻下了广州和韶州部分地区后，十分高兴。
他下令封严天凤为平东侯、杨怀为忠勇侯、林察为辅明侯、孙贵为定海侯，其余诸将皆有封赏。
又令思恩游击袁来朝领兵四千增援严天凤。
为了筹措战争经费，朱亨嘉下令增设雷州府海康所海关、肇庆府阳江海关；又下令户部海关司接管广州府澳门海关。
自嘉靖三十二年，佛朗机人进入和租居澳门后，大明朝一直设有澳门海关，收取关税。不过以前的海关是由广东布政使司下面的广东市舶司和香山县共同管理的。朱亨嘉觉得海关十分重要，取消了各地的市舶司，由户部直接设海关司，各海关设海关分司，垂直管理。
为了让广西拥有出海口，朱亨嘉下令把廉州府划入广西，改孙贵为广西水师总兵，改林察为广东水师总兵。