这个世界存在着某种与科学相关的异能法则，以此法则为探索目标，人类创造出调用地壳能量的【炼金术】以及调用地脉能量的【炼丹术】。
正常情况下，此异能受多种因素制约：其一、特定的图案，想制造不同的异象需要不同的图案；其二，拥有与炼成阵对应的科学知识，无法理解该物质的构造、分解、再构筑的人，就算有炼成阵也无法引发异象；其三、等价交换法则，无法无中生有，一份质量的物体只能产生同样一份质量的物体；其四，使用者自身的某种力量，会将水炼成冰的人一大票，世界的能量就在脚下，但没有谁能够调用整个星球的能量、将大海全部变成冰。
非正常的情况也是存在的，这个世界已可使用‘灵魂’的能量。接触到灵魂层面的探索者将从世界深处领悟到更深层次的法则，可通过‘双掌合拢’省略炼成阵的绘制；若是将大量的灵魂视为消耗品，还可以无视等价交换法则，进行无中生有的炼成或非物质层面的炼成。
而正是某次非物质层面的炼成，给世界带来长久的隐患。
古代王国赛尔克塞斯王室为求长生不老之道，以奴隶-霍恩海姆的血为基础材料，牺牲多名其他奴隶炼成出【烧瓶中的小人（简称‘阿神’）】。阿神为了得到自由，唆使王室在国内画下国土炼成阵并在五个地方进行大屠杀，将自己和霍恩海姆的身体一起炼成为由高密度灵魂组成的【贤者之石】。
得到自由的阿神并不满足于此，他还想得到神的力量，成为完全的存在。他把自己的傲慢、嫉妒、暴怒、懒惰、贪婪、暴食、色欲分离出来制造【人造人】，驱使能力各异的孩子们暗中建立亚美斯多利斯国并持续扩张。
如今亚美斯多利斯国总人口已超过当年的赛尔克塞斯王国，阿神的计划步入后期，一边让【懒惰】在地下挖掘国土炼成阵，一边让时任总统【愤怒】发动侵略战争，打算以伊修瓦尔族人的鲜血作为国土炼成阵的五大印章之一。
然而——
（嘭！）未来将更名为‘斯卡’的武僧闯入地下室，即将解救改变这场战争的走向的男人。
“……好吵啊，外面……”因为亵渎地神-伊修瓦尔神而被身为族长的祖父下令关押一年之久的莱尔，双手分开被两条铁链吊着，垂着脑袋坐在地板上，似乎刚睡醒的样子。
“莱尔，大哥说你是族内最强的战士，我们需要你的帮忙！”斯卡拿着以违规手段得来的钥匙，给莱尔带来久违的自由。
他没有防备莱尔偷袭，说到底莱尔也没干什么伤天害理的坏事，只是不信奉全体伊修瓦尔族人都信奉的地神，而他刚好是族长一脉的子孙，族长为了作表率不得不从严处理。
“大哥……？啊，你好像是小近的傻大个弟弟。”斯卡的大哥是个沉迷炼金术的近视眼，是莱尔入狱前唯一的男性朋友，因这层关系，他入狱前其实是见过斯卡数次的，“所以，你们正在打仗？”
不是‘我们’而是‘你们’，一年的牢狱之灾让莱尔的态度发生改变。
“你连亚美斯多利斯正在攻打我们都不知道？”斯卡瞪大双眼。
莱尔揉揉手腕，站起身来，嘲弄地说道：“毕竟我只是一个囚犯，一个亵渎神的罪人，你们没有一把火将我烧死已是宽宏大量，哪敢要求你们每天将时事新闻念给我听啊。”
“…………”斯卡哑口无言，知道自己问了个蠢问题。
“老实说，我挺想将家里的老家伙们全部弄死的，完全没有动力为保护向我丢石头的族人而战。”莱尔活动了下身体，缓缓走向通往地面的楼梯，“只不过，看在你和你哥释放我的情面上，仅此一次的参战吧。”
斯卡脚步略微一滞，莱尔的发言让他感到很不安，但一想到每天都有族人死亡，战争的势头越来越不利，血气方刚的他马上抛开疑虑，跟随莱尔走出地下室。
“唔~~！阳光和清新的空气~！”无视远方的枪声和硝烟，莱尔只想高歌一曲赞颂自由的美好。
斯卡很不体贴地打断时隔一年重见天日的莱尔的好心情，催促道：“战场在那边！”
“别急，就算不给我吃饱喝足的时间，也给我点战前准备时间。”莱尔没好气地摇摇头，旁边随便找了块小石头，蹲在地面绘制出一个构图相当复杂的炼成阵。
斯卡在旁默不作声地看着，他平常经常看老哥绘制这些玩意，知道炼金术师的战斗方式与常人不同。
“呵~不知道这算不算人体炼成呢~”莱尔淡然一笑，随手抛开简陋而实用的绘图工具，双手印在炼成阵上。
（滋滋滋）炼成的白色电光跳动着。
地壳的力量进入莱尔的身体，全身皮肤的色素分布调整。在肤色变得白皙，失去身为伊修瓦尔人‘红色的眼睛’、‘褐色的皮肤’、‘白色的头发’三大外貌特征之一的同时，全身上下满布类似纹身的黑色线条和图案。
“跟大哥的手臂相似的东西……？”斯卡在亲人身上看过类似的东西，不同之处仅在于他的大哥是真正的纹身，而莱尔是在炼成自己的身体。
附带一提，因为某些原因，莱尔很难达到‘触犯炼金术禁忌’的标准，最起码不是调整色素分布的小炼成就能抵达真理之门。
“哦~他也觉得画炼成阵很麻烦吗？有空可以去看看他的炼成阵画得怎么样，但现在——”莱尔一跺脚，身上的一部分黑色线条和图案发出电光，炼成的电光于脚下大地亮起，并一直传导至远方。
（隆隆隆）地动山摇，高耸而厚实的石制城墙缓缓升起，将伊修瓦尔族人生活的这片土地围在里头。
“什、什么！？”斯卡双脚一软，跌坐在地上，他面上的震惊也不知道是因为那些城墙还是因为莱尔。
“没必要这么惊讶，这不就是你将我释放出来的原因吗？”莱尔身上另一个部分的炼成阵发出电光，数十米开外的一棵树被某种力量扯了过来，其一部分树叶、树枝、树皮炼成为衣服、裤子、鞋子。
连换衣服的功夫都省了，在地下室里穿了不知道多久的那身衣服直接分解掉，新衣物直接炼成在身体上。虽然材质不怎么样，穿着也不舒服，但好歹干净齐整。
“那么……”莱尔转过身，走向战场所在的方向，轻笑道，“让我看看正统的炼金术师，跟我这个炼金术和炼丹术双修的自学者，有什么不一样~”
最终，阿神的计划成功推进一大步，伊修瓦尔地区染满了鲜血。
只是人造人们的剧本是【红莲之炼金术师-金布利，以贤者之石的力量屠杀伊修瓦尔人】，而现实的发展是【现人神-莱尔，屠杀亚美斯多利斯军人，红莲之炼金术师-金布利以贤者之石的力量为败军撤退争取到时间】。